Το λιμάνι της Χίου είναι το κεντρικό λιμάνι του νησιού και βρίσκεται στο κεντρικό - ανατολικό τμήμα της Χίου. Απέχει 3,5 ναυτικά μίλια από τη χερσόνησο της Ερυθραίας στο ύψος του Τσεσμέ. Η μέγιστη χωρητικότητα σε πλοία είναι 2 επιβατηγά/φορτηγά των 20.000 τόνων έκαστο και ένα των 700 τόνων. Το μέγιστο βάθος του λιμένα είναι 8,20 μέτρα.

Η Χίος συνδέεται με την ηπειρωτική Ελλάδα με τακτικά δρομολόγια πλοίων από το λιμάνι του Πειραιά και της Καβάλας.

Στο νότιο τμήμα του υπάρχει μαρίνα, η οποία φιλοξενεί πολλά αλιευτικά, ιστιοπλοϊκά σκάφη αλλά και σκάφη αναψυχής.

Η Χίος διαθέτει επίσης και το λιμάνι των Μεστών στα νοτιοδυτικά του νησιού.