Το λιμάνι της Αλεξανδρούπολης είναι από τα σημαντικότερα λιμάνια όλης της Ελλάδας. Πρόκειται για το μοναδικό μεγάλο λιμάνι της Θράκης και είναι ο σπουδαιότερος εμπορικός κόμβος της περιοχής. Δέχεται επιβατηγά, εμπορικά, αλιευτικά και τουριστικά σκάφη. Καθώς το σιδηροδρομικό δίκτυο της Περιφέρειας συνδέεται με το λιμάνι της Αλεξανδρούπολης, υπάρχει η δυνατότητα φορτοεκφόρτωσης εμπορευμάτων από πλοία σε βαγόνια και αντίστροφα, σε δύο προβλήτες.

Το λιμάνι της Αλεξανδρούπολης συνδέεται ακτοπλοϊκά με καθημερινά δρομολόγια με το νησί της Σαμοθράκης, ενώ κατά τη θερινή περίοδο εκτελούνται και δρομολόγια με τα νησιά του Βορειοανατολικού Αιγαίου.

Η είσοδός του έχει άνοιγμα 155 μέτρα, το ελάχιστο βάθος του λιμανιού Αλεξανδρούπολης είναι τα 6,5 μέτρα και έχει τη δυνατότητα υποδοχής πλοίων μήκους έως 200 μέτρων. Προστατεύεται από δύο λιμενοβραχίονες, το νοτιοδυτικό και τον ανατολικό.