Το Λιμάνι Χώρας Σκοπέλου είναι το μεγαλύτερο λιμάνι του νησιού. Πρόκειται για ένα νέο, μεγάλο σε μέγεθος και καλοδιατηρημένο λιμάνι που βρίσκεται στη μέση της Χώρας, ενώ το παλιό λιμάνι, βρίσκεται στην αριστερή άκρη της πόλης, κάτω από τη δημοφιλή εκκλησία Παναγίτσα του Πύργου. Όλα τα πλοία και τα καταμαράν φυσικά ελλιμενίζονται στο νέο λιμάνι.

Η Σκόπελος συνδέεται με την ηπειρωτική Ελλάδα με δρομολόγια πλοίων από τα λιμάνια του Βόλου, της Εύβοιας (Μαντούδι, Κύμη), του Αγίου Κωνσταντίνου και της Θεσσαλονίκης.

Επίσης εκτελούνται απευθείας δρομολόγια προς Σκιάθο και Αλόννησο καθ' όλη τη διάρκεια του χρόνου.

Απέναντι από τα δύο λιμάνια λειτουργούν τουριστικά πρακτορεία. Και στα δύο λιμάνια επίσης υπάρχουν καφετέριες και ταβέρνες.

Οι στάσεις των ταξί και των τοπικών λεωφορείων βρίσκονται ακριβώς στα αριστερά του νέου λιμανιού. Λίγα μέτρα πιο πέρα βρίσκεται το δημοτικό πάρκινγκ της Χώρας Σκοπέλου.