Το λιμάνι της Σκιάθου συνδέεται με την ηπειρωτική Ελλάδα με συχνά δρομολόγια πλοίων από το λιμάνι του Βόλου. Η ακτοπλοϊκή σύνδεση Βόλος - Σκιάθος εξυπηρετείται καθημερινά και η διάρκεια της διαδρομής είναι λίγο πάνω από 1 ώρα με ταχύπλοο και περίπου 2,5 ώρες με συμβατικό πλοίο.

Επίσης το λιμάνι της Σκιάθου συνδέεται ακτοπλοϊκά και με το Μαντούδι της Εύβοιας. Από τη Σκιάθο εκτελούνται απευθείας δρομολόγια για τα εξής λιμάνια:

Σκόπελος: Το ταξίδι Σκιάθος - Σκόπελος διαρκεί μόλις 15-30 λεπτά με ταχύπλοο και γύρω στη 1,5 ώρα με συμβατικό πλοίο.
Αλόννησος: Το ταξίδι Σκίαθος - Αλόννησος κρατάει από 1,5 μέχρι 2,5 ώρες.
Μαντούδι Εύβοιας: Το ταξίδι Σκιάθος - Μαντούδι διαρκεί από περίπου 1,5 έως 4,5 ώρες ανάλογα με το δρομολόγιο.